จากจุดเริ่มต้นของเทคโนโลยีชีวภาพ fungal recombinant ยีสต์ Saccharomyces cerevisiae ถูกอินทรีย์โฮสต์ที่ใช้บ่อยที่สุดสำหรับการผลิต heterologous วิลเลียม ส่วนใหญ่การพัฒนาของเทคโนโลยีชีวภาพ fungal ถูกเริ่มต้น โดยการทำงานกับอินทรีย์นี้

ในปีล่าสุด species อื่น ๆ ยีสต์ เช่น Kluyveromyces lactis, Hansenula polymorpha และPichia pastoris ได้กลายมาเป็นสามารถเข้าถึงได้สำหรับโปรแกรมประยุกต์กับวิลเลียม recombinant น่าสนใจ ในบางกรณี yeasts ไม่ express eukaryotic ยีนส์ที่เข้ารหัสโปรตีนที่จำเป็นต้องมีการปรับเปลี่ยน posttranscriptional (เช่น glycosylations) ในทางตรงข้าม filamentous เชื้อราจะสามารถสังเคราะห์โปรตีนเหล่านี้ในแบบฟอร์มการทำงานได้อย่างเต็มรูปแบบบางอย่าง ระบบ Simultaneous กับการพัฒนาของโมเลกุลพันธุเทคนิคและระบบการถ่ายโอนยีนในยีสต์ เปรียบได้ถูกก่อตั้งขึ้นสำหรับเชื้อรา filamentous ทำให้เมื่อยปรับปรุงเป็นไปได้ ได้มีใช้เชื้อรา Filamentous สำหรับทศวรรษเป็นผู้ผลิตหลักใน pharmaceutical อาหาร และการประมวลผลอาหาร อุตสาหกรรม นำไปเป็นมาตรฐานทางด้านเทคนิคสูงในกระบวนการหมักดองกับ fermenters ขนาดใหญ่ นี้ กับข้อเท็จจริงที่ว่า เชื้อรา filamentous จำนวนมากมีดิกราสที่รู้จัก ("โดยทั่วไปว่าเป็นเซฟ ในคำศัพท์ของสหรัฐฯ อาหารและยา) สถานะ ทำให้สิ่งมีชีวิตในที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการผลิต recombinant โปรตีน

เชื้อรา filamentous จำนวนมาก มีสถานะเป็นดิกราสเป็นสิ่งมีชีวิตในมาตรฐานสำหรับหมักขนาดใหญ่ดอง ได้ขับจำนวนมากวิลเลียม และดังนั้นจึง มีสิ่งมีชีวิตในโฮสต์ที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการผลิต recombinant โปรตีน ประเภท ที่รวมอยู่ในนี้คือประเทศไนเจอร์ Aspergillus, Aspergillus oryzae, Acremonium chrysogenum, Penicillium chrysogenum และTrichoderma reesei ท่ามกลางผู้อื่น